《南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)-自然科學(xué)版》是中國綜合醫(yī)藥衛(wèi)生類核心期刊，本刊創(chuàng)辦于1956年，其前身是《蘇醫(yī)學(xué)報(bào)》、《南京醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào)》，1996年隨校名更改為《南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)》。2001年進(jìn)入國家期刊方陣，連續(xù)被《中文核心期刊要目總覽》第3、4、5、6、7、8、9版收錄，為中國科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫（CSCD）來源期刊、中國科技論文統(tǒng)計(jì)源期刊（中國科技核心期刊），同時(shí)被美國《化學(xué)文摘》（CA）、美國《烏利希期刊指南》（Ulrich's Periodicals Directory ）、波蘭《哥白尼索引》（IC）、《日本科學(xué)技術(shù)振興機(jī)構(gòu)中國文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫》（JSTChina）等著名檢索工具收錄。 

本刊接受全國各醫(yī)藥高等院校及醫(yī)院教學(xué)、醫(yī)療、科研人員在基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)方面的論著、科研簡報(bào)、技術(shù)方法、經(jīng)驗(yàn)交流、短篇報(bào)道、病例報(bào)告等。凡國家、省基金資助項(xiàng)目或獲獎(jiǎng)成果論文，經(jīng)審稿通過后將優(yōu)先發(fā)表。本刊以促進(jìn)校內(nèi)外的學(xué)術(shù)交流為宗旨，為提高我校的教學(xué)、科研水平和人才培養(yǎng)服務(wù)，為科教興國、科教興省的戰(zhàn)略決策服務(wù)。本刊也歡迎海外校友、學(xué)者來稿。

在國際上，《南京醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)-自然科學(xué)版》業(yè)已被美國《化學(xué)文摘》(CA)、美國《生物學(xué)文摘》(BA)、俄羅斯《期刊索引》(AJ)等著名檢索工具收錄。在國內(nèi)，中國科技論文與引文數(shù)據(jù)庫、中國科技期刊引證報(bào)告、中國科學(xué)技術(shù)期刊文摘(CSTA)數(shù)據(jù)庫(英文版)、中國學(xué)術(shù)期刊(光盤版)全文檢索系統(tǒng)、《中國生物學(xué)文摘》、《中國藥學(xué)文摘》、《中國醫(yī)學(xué)文摘》等16種檢索類刊物均將我刊作為主要引用源之一。